基于空间自相关分析研究毛红椿天然居群的空间遗传结构*

doi:10.11707/j.1001-7488.20080609

林业科学 ›› 2008, Vol. 44 ›› Issue (6): 53-59.doi: 10.11707/j.1001-7488.20080609

基于空间自相关分析研究毛红椿天然居群的空间遗传结构*

刘军¹ 陈益泰¹ 孙宗修² 姜景民¹ 何贵平¹ 饶龙兵¹ 吴天林¹

（1．中国林业科学研究院亚热带林业研究所富阳311400；2．中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室杭州310006）

收稿日期:2007-04-23 修回日期:1900-01-01 出版日期:2008-06-25 发布日期:2008-06-25

Spatial Genetic Structure of Toona ciliata var. pubescens Populations in Terms of Spatial Autocorrelation Analysis

Liu Jun¹,Chen Yitai¹,Sun Zongxiu²,Jiang Jingmin¹,He Guiping¹,Rao Longbin¹,Wu Tianlin¹

(1.Research Institute of Subtropical Forestry, CAF Fuyang 311400；2.State Key Laboratory of Rice Biology, China National Rice Research Institute Hangzhou 310006)

Received:2007-04-23 Revised:1900-01-01 Online:2008-06-25 Published:2008-06-25

摘要/Abstract

摘要：

利用8对微卫星标记对分布于我国的3个毛红椿天然居群的遗传结构进行研究。收集毛红椿3个天然居群209个单株材料并对每个单株的位置进行定位，运用空间自相关分析研究毛红椿居群的空间遗传结构，了解该物种的进化历程和濒危机制，并为制定有效的保护策略和措施提供科学依据。研究结果表明：1) 居群等位基因的平均数为5.3，有效等位基因数平均为2.6；2）观察杂合度平均为0.599 0，期望杂合度平均为0.589 3；3）空间自相关分析结果揭示毛红椿宜丰天然居群在0～240 m存在着显著的空间遗传结构；4) 宾川和师宗居群内遗传变异在空间上为随机分布，不存在明显的空间遗传结构；5) 导致居群内空间遗传结构形成的原因，包括花粉种子局限传播、微环境异质性和居群密度等。

关键词: 毛红椿, 空间遗传结构, 空间自相关分析, 微卫星

Abstract:

Population genetic structure with 209 individuals in three located natural populations of Toona ciliata var. pubescens was analyzed with 8 microsatellite markers.This study intended to find out species evolutionary history and endangered mechanism and offer scientific foundation for establishing efficient conservation strategies. The spatial genetic structure of T.ciliata var. pubescens was measured with spatial autocorrelation analysis. Spatial autocorrelation coefficient, which was used to reveal spatial structure of genetic variation, was calculated within the populations of Yifeng, Binchuan and Shizong. The results showed: 1) The average number and the effective number of alleles(N_e) were 5.3 and 2.6, respectively; 2) The average observed heterozygosity was 0.599 0, while the average expected heterozygosity was 0.589 3; 3) There was significant variation in spatial genetic structure of natural population at Yifeng, indicated with significant positive autocorrelation over 0～240 m; 4) Genetic variance in populations of Binchuan and Shizong was distributed randomly; 5) Spatial genetic structure was mainly affected by limited dispersal of pollens and seeds, heterogeneity of microenvironment and density of population.

Key words: Toona ciliata var. pubescens, spatial genetic structure, spatial autocorrelation analysis, microsatellite

刘军陈益泰孙宗修姜景民何贵平饶龙兵吴天林. 基于空间自相关分析研究毛红椿天然居群的空间遗传结构*[J]. 林业科学, 2008, 44(6): 53-59.

Liu Jun;Chen Yitai;Sun Zongxiu;Jiang Jingmin;He Guiping;Rao Longbin;Wu Tianlin. Spatial Genetic Structure of Toona ciliata var. pubescens Populations in Terms of Spatial Autocorrelation Analysis[J]. Scientia Silvae Sinicae, 2008, 44(6): 53-59.

[1]	郭晓燕, 温婷, 张露, 杜天真, 吴南生, 付立. 毛红椿落叶腐解物的化感作用及成分[J]. 林业科学, 2018, 54(6): 24-32.
[2]	文亚峰, 韩文军, 周宏, 徐刚标. 杉木转录组SSR挖掘及EST-SSR标记规模化开发[J]. 林业科学, 2015, 51(11): 40-49.
[3]	邵霜霜, 师庆东. 基于FVC的新疆植被覆盖度时空变化[J]. 林业科学, 2015, 51(10): 35-42.
[4]	刘政捷, 林源, 周明兵, 汤定钦. 应用微卫星分子标记估算毛竹的异交率[J]. 林业科学, 2014, 50(8): 76-81.
[5]	温强, 徐林初, 江香梅, 李江, 顾胤聪, 徐立安, 黄敏仁. 基于454测序的油茶DNA序列微卫星观察与分析[J]. 林业科学, 2013, 49(8): 43-50.
[6]	黄红兰, 张露, 郭晓燕, 梁跃龙, 刘足根. 九连山毛红椿种群的结实特性及其生殖力[J]. 林业科学, 2013, 49(7): 170-174.
[7]	张新叶, 张亚东, 彭婵, 宋丛文, 杨彦伶. 水杉基因组微卫星分析及标记开发[J]. 林业科学, 2013, 49(6): 160-166.
[8]	马秋月, 戴晓港, 陈赢男, 张得芳, 廖卓毅, 李淑娴. 枣基因组的微卫星特征[J]. 林业科学, 2013, 49(12): 81-87.
[9]	黄平;崔娇鹏;郑勇奇;张川红. 基于月季微卫星标记的7个遗传相似系数比较[J]. , 2013, 49(1): 68-76.
[10]	刘华波;王哲;刘君;麻丽颖;王斯琪;唐岩;庞晓明. 燕山山脉西伯利亚杏的遗传多样性和遗传结构[J]. 林业科学, 2012, 48(8): 68-74.
[11]	程丽莉　黄武刚　周志军　刘建立　王艳梅　苏淑钗　翟明普. 欧洲榛微卫星对我国榛属种质资源的分析[J]. 林业科学, 2009, 12(2): 22-26.
[12]	黄武刚程丽莉周志军刘建立. 板栗野生居群与栽培品种间叶绿体微卫星遗传差异初探*[J]. 林业科学, 2009, 12(10): 62-68.
[13]	艾畅;徐立安赖焕林黄敏仁王章荣. 马尾松种子园的遗传多样性与父本分析[J]. 林业科学, 2006, 42(11): 146-150.
[14]	张星耀赵嘉平梁军吕全. 树木溃疡病菌主要类群系统地位及茶藨子葡萄座腔菌的种内一致性[J]. 林业科学, 2006, 42(11): 63-68.
[15]	李淑娴尹佟明邹惠渝丁雨龙黄敏仁. 用水稻微卫星引物进行竹子分子系统学研究初探[J]. 林业科学, 2002, 38(3): 42-48.

基于空间自相关分析研究毛红椿天然居群的空间遗传结构*

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