板栗野生居群与栽培品种间叶绿体微卫星遗传差异初探*

doi:10.11707/j.1001-7488.20091011

林业科学 ›› 2009, Vol. 12 ›› Issue (10): 62-68.doi: 10.11707/j.1001-7488.20091011

板栗野生居群与栽培品种间叶绿体微卫星遗传差异初探*

黄武刚¹ 程丽莉¹ 周志军² 刘建立³

1.北京市农林科学院林业果树研究所北京 100093； 2. 昌平林业局北京 102200； 3. 北京林业大学水土保持与荒漠化教育部重点实验室北京 100083

收稿日期:2009-02-11 修回日期:1900-01-01 出版日期:2009-10-25 发布日期:2009-10-25
通讯作者: 程丽莉
基金资助:

Diversity of Chloroplast DNA SSRs in the Wild and Cultivated Chestnuts(Castanea　mollissima)

Huang Wugang¹,Cheng Lili¹,Zhou Zhijun¹,Liu Jianli³

1. Institute of Forestry Pomology Academy of Agricultural and Forestry Sciences Beijing 100093; 2. Changping County Forest Department Beijing 102200;3. Key Laboratory of Soil and Water Conservation & Desertification Combating of Ministry of Education Beijing Forestry University Beijing 100083

Received:2009-02-11 Revised:1900-01-01 Online:2009-10-25 Published:2009-10-25
Supported by:

摘要/Abstract

摘要：

对24对cpSSR通用引物进行筛选，选用4对呈现多态性的引物对板栗的4个野生居群和9个地方品种群进行遗传分析。结果表明： 4个位点在128个样本中扩增等位基因数（N_a）平均为3，有效等位基因数（N_e）平均为1.635，期望杂合度（H_e）平均为0.381，各遗传参数值远低于核基因组对群体研究的相应值。4个等位基因共组合出8种单倍型，既有共享率超过57%的单倍型，也存在特异稀有单倍型，其中陕西汉中与安徽广德板栗天然野生居群，具有较高的单倍型多样性，分别为0.671和0.781，明显高于其他地区，显示两地是板栗的分布及遗传多样性中心。基于cpSSR数据，对板栗地方品种与天然野生居群间的遗传结构、关系及地方品种的起源进行初步探讨。

关键词: 板栗, 叶绿体微卫星, 单倍型, 遗传差异

Abstract:

In this study 24 cpSSR primer pairs were screened, and four pairs were found producing DNA fragment length polymorphism from the tested populations of Castanea mollissima. In order to estimate genetic variation and genetic structure of chestnut, we surveyed four wild and nine cultivated populations in China with cpSSR markers. The results showed there were 3 average number of alleles (N_a), 1.635 effective number of alleles (N_e) and 0.381 expected heterozygosity (H_e), from 4 loci in 128 samples. Apparently, the parameters of cpSSR loci were much lower than those revealed by nuclear SSRs. The combinations of all the length variants of alleles from four cpSSR loci finally presented eight haplotypes in the nine populations of C. mollissima. The Qinling mountainous region and Tianmushan mountainous regions possessed the richest haplotype diversity (respectively 0.671 and 0.781). Based on cpSSR data, we estimated the genetic structures of the wild and cultivated chestnut populations and discussed the origins of the cultivated C. mollissima in China.

Key words: Castanea mollissima, cpSSR, haplotype, genetic diversity

中图分类号:

黄武刚程丽莉周志军刘建立. 板栗野生居群与栽培品种间叶绿体微卫星遗传差异初探*[J]. 林业科学, 2009, 12(10): 62-68.

Huang Wugang;Cheng Lili;Zhou Zhijun;Liu Jianli. Diversity of Chloroplast DNA SSRs in the Wild and Cultivated Chestnuts(Castanea　mollissima)[J]. Scientia Silvae Sinicae, 2009, 12(10): 62-68.

[1]	尹淑艳, 李波, 周成刚, 张卫光, 谢丽霞, 刘永杰. 基于28S rDNA分析板栗和杉木上针叶小爪螨物种分化原因[J]. 林业科学, 2019, 55(4): 122-128.
[2]	王广鹏, 张树航, 李颖, 郭燕, 张馨方. 修剪省工板栗新品种‘替码明珠’[J]. 林业科学, 2016, 52(10): 168-168.
[3]	柏宏伟, 成军, 杨柳, 姜奕晨, 曹庆芹, 张卿, 秦岭. 板栗雄花序萃取物抗氧化及抑菌效果[J]. 林业科学, 2015, 51(5): 145-152.
[4]	刘庆香, 商贺利, 张树航, 李颖, 王广鹏. 板栗良种‘燕宽’[J]. 林业科学, 2015, 51(5): 166-166.
[5]	李颖, 王广鹏, 张树航, 刘庆香, 李海山. 板栗新品种‘明丰2号’[J]. 林业科学, 2015, 51(11): 145-145.
[6]	兰彦平, 陈晶晶, 黄荣凤, 郭飞. 板栗年轮结构对北京地区气候因子的响应分析[J]. 林业科学, 2014, 50(11): 23-29.
[7]	郭素娟;谢鹏. 外源物质对板栗淀粉合成及相关酶活性的影响[J]. 林业科学, 2013, 49(4): 135-140.
[8]	祝美云;林顺顺;梁丽松;王贵禧. 脱脂脱蛋白处理对不同糯性板栗粉糊化特性的影响[J]. 林业科学, 2012, 48(5): 29-35.
[9]	赵天田;梁丽松;林顺顺;张柏林;王贵禧. 板栗淀粉表面结合脂中脂肪酸的组成[J]. 林业科学, 2012, 48(2): 96-102.
[10]	姜淑霞;刘传忠;王庆华;贾宁;李超;马洪兵. 板栗新病害褐缘叶枯病及病原鉴定[J]. 林业科学, 2011, 47(5): 177-180.
[11]	秦岭;杨东生;高天放;周自军;王铁明;冯永庆;田瑞冬. 板栗新品种‘短花云丰’[J]. 林业科学, 2011, 47(4): 194-194.
[12]	梁丽松;张柏林;林顺顺;王贵禧. 淀粉表面结合脂对板栗淀粉糊化特性的影响[J]. 林业科学, 2011, 47(11): 59-65.
[13]	陈在新;潘娟;江道菊. 不同成熟期板栗品种(系)种子发育期主要营养物质与内源激素含量的动态变化[J]. 林业科学, 2011, 47(1): 73-78.
[14]	尹淑艳<sup></sup>徐常青<sup></sup>崔孝平<sup></sup>吴爱莲<sup></sup>孙绪艮<sup></sup>. 针叶小爪螨板栗和杉木种群的形态差异[J]. 林业科学, 2010, 46(6): 166-170.
[15]	唐征杨凯冯永庆曹庆芹沈元月秦岭 . 板栗脂质转运蛋白基因的克隆及表达[J]. 林业科学, 2010, 46(4): 43-48.

板栗野生居群与栽培品种间叶绿体微卫星遗传差异初探*

Diversity of Chloroplast DNA SSRs in the Wild and Cultivated Chestnuts(Castanea　mollissima)

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

作者中心

期刊获奖

引证指标

联系方式

板栗野生居群与栽培品种间叶绿体微卫星遗传差异初探*

Diversity of Chloroplast DNA SSRs in the Wild and Cultivated Chestnuts(Castanea mollissima)

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

作者中心

期刊获奖

引证指标

联系方式

Diversity of Chloroplast DNA SSRs in the Wild and Cultivated Chestnuts(Castanea　mollissima)