林业科学 ›› 2010, Vol. 46 ›› Issue (11): 8-15.doi: 10.11707/j.1001-7488.20101102
杜庆章1,2王博文1,2王保垒1,2 张曼3李百炼1,2张志毅1,2张德强1,2
Du Qingzhang1, 2Wang Bowen1, 2Wang Baolei1, 2Zhang Man3Li Bailian1, 2Zhang Zhiyi1, 2 Zhang Deqiang1, 2
摘要:
利用直接测序法开发木材形成功能基因内一套新的核基因组SSR标记。通过对参与木材形成的16个基因在40个毛白杨基因型个体中的序列比较分析,共检测到20个SSR多态性位点。在毛白杨自然群体中,SSR多态性位点的碱基重复呈现出二碱基、三碱基、五碱基、六碱基与七碱基形式,基元重复次数变异范围为2~34次,其中以二碱基重复的位点较多,占总数的55.0%。在此基础上,依据SSR位点两侧的保守序列,设计20对SSR位点PCR扩增引物对。利用设计的引物检测开发的SSR位点在杨属内15个基因型个体中PCR扩增的有效性及SSR位点的保守性。PCR扩增结果显示,90.0%的SSR位点能够在杨属至少2个派内有效扩增,每对引物组合可检测到SSR多样性位点数为3~9个,平均5.3个。开发的这些SSR位点在功能基因内不同区域的分布频率不同。