%A 牛苏燕, 范国强, 赵振利, 邓敏捷, 董焱鹏 %T 泡桐的microRNAs及其功能预测 %0 Journal Article %D 2013 %J 林业科学 %R 10.11707/j.1001-7488.20131110 %P 77-82 %V 49 %N 11 %U {http://www.linyekexue.net/CN/abstract/article_6523.shtml} %8 2013-11-25 %X

以不同种(品种)泡桐叶片为材料,利用第二代高通量测序技术和生物信息学方法构建泡桐小RNA(sRNA)文库,并对其microRNA (miRNA)靶基因功能进行分析。结果表明:在得到的87 066 707条高质量reads中,能与泡桐转录组完全匹配的有41 399 208条,占高质量序列的47.55%。sRNA长度主要分布在 20~25 nt 之间,其中,长度为24 nt 的数量最多,其次为21 nt的sRNA。鉴定出的44 个保守miRNA分属于14 个不同miRNA家族,并且不同miRNA家族的miRNA成员数量也存在差异。对鉴定出的27个新miRNA进行靶基因预测及功能分析,结果为阐明miRNAs在泡桐生长发育过程中的作用奠定基础。